劉安恭批評毛澤東“一切權力獨攬，搞書記專政，傢長制”、“不服從中央指示”、“不服從中央調動”。劉安恭對毛澤東的批評在代表中產生瞭不好的影響，但作為會議主持人的陳毅，當時並沒有及時地站出來控制這種不正常的氣氛發展下去，這後來也讓陳毅感到深深的愧疚。
其實在大會召開前，毛澤東曾特意找到陳毅，請他在會上出面肯定一下自己在紅四軍創建及發展中的歷史地位和功績，然而讓毛澤東沒有想到的是，他的提前打招呼卻起瞭反作用。陳毅在會上竟然也公開對朱德、毛澤東二人開火，這讓毛澤東、朱德及其他代表都感到十分意外。
會上，陳毅指責毛澤東說：“毛澤東同志是傢長式管理，搞得是一言堂，誰也說的不對，隻有他說的對，他說馬克思主義要和中國革命的實際相聯系，這是對馬克思主義的低估和信任不夠，是認識模糊。……”他批評朱德“是舊軍隊裡面出來的，江湖義氣濃厚，什麼都是一幫一夥的，搞的是傢天下，不得人心。從來不重視政治思想工作，總以為自己就可以包打天下，那麼，還要黨幹什麼”?最後，連劉安恭也被他批評瞭一通。
最後陳毅又對毛澤東、朱德二人說到：“你們是秦、晉大國，我是小國，處在你們大國之間，我哪邊都不好得罪。我就是怕紅軍分裂，所以，就請你們高抬貴手，盡快和解為上”。在場的人聽後都大笑不止。
對此，毛澤東異常惱火，他坐在那裡不停地吸煙，一言不發。陳毅的發言得到瞭紅四軍多數官兵的贊同。會後選舉時，毛澤東、朱德二人都落選瞭，陳毅被選為前委書記。後來，據出席會議的羅榮桓、羅瑞卿、蕭華、譚政等人回憶：投票選舉時，毛澤東隻差一票，而陳毅卻把這一票投給瞭其他人，最終導致毛澤東落選。
會議對毛澤東、朱德間的爭論做出的處理是，毛澤東身為黨代表、前委書記，應負較大責任，給予毛澤東嚴重警告處分;給予朱德以書面警告處分。會議結束後，毛澤東憤然離開紅四軍到蛟洋去養病。
毛澤東堅決反對“陳毅主義”
1929年7月29日，國民黨軍隊通過合圍的方式對閩西根據地發起進攻，計劃用一個星期的時間把閩西根據地解決掉。緊急時刻，陳毅、朱德連夜趕到毛澤東的住地蛟洋討論對敵策略。
對此，毛澤東顯得處變不驚，他說：我們不要硬拼，敵人來瞭，我們分散轉移，縮小目標，轉移敵人視線，分散敵人力量。等敵人走瞭，我們再打回來。如果三省“會剿”之敵進攻閩西，我們就取道閩北入贛東、贛南，或入福州、延平之間活動;或兵分兩路，一路往閩北，一路留閩西。